細菌原位雜交介紹之三-----不同標本類型的檢測
1.培養(yǎng)后的細菌原位雜交:
(1) 細菌FISH探針的濃度為25-60μg/ml,即大約5-25μM濃度,雜交液稀釋20-50倍。
(2) 將菌株震蕩混合10秒,用鉆石筆在玻璃上畫圈,利用移液槍滴加50μL的細菌,并將載玻片置于37℃或室溫干燥后1-24小時。
(3) 利用梯度乙醇濃度(50%,85%和95%)脫水,每次3分鐘。在100%乙醇中脫水后,將載玻片風干,約1-60分鐘。
(4) 雜交液稀釋細菌探針(1:50)。取50μL探針溶液加在玻片上,加玻片,多出溶液用紙巾擦拭。放入孵育盒,然后蓋好密封蓋,避光48°C中雜交5小時或37℃過夜。
(5) 配置洗滌緩沖液(700mM NaCl 72 mL, 17mM Tris/HCl,0.1% SDS),在46°C或37℃的水浴中浸泡30分鐘。
(6) 再利用純水浸泡10分鐘,去除多余的鹽分。每片加50μL 抗熒光淬滅劑DAPI,室溫避光靜置20分鐘。熒光顯微鏡下,觀察結(jié)果,拍照。
2.新鮮組織的細菌原位雜交:
(1) 取材新鮮活體組織,使用卡氏固定液,固定3-12小時。石蠟包埋,切片5-8μM。
(2) 二甲苯中浸泡2次,10分鐘每次,在梯度乙醇50%,80%和95%中,按順序脫水,每次3分鐘,晾干標本,約1-2小時。
(3) 將雜交液與探針按照25:1稀釋細菌探針。取50μL探針溶液加在玻片上,加玻片,紙巾擦拭干凈。放入保濕孵育盒,封蓋,避光48°C中雜交5小時,或37℃過夜。
備注:如果是陳舊標本需要使用細菌原位雜交試劑進行處理,如需要,請聯(lián)系我們。
(4) 洗滌緩沖液(700mM NaCl 72 mL, 17mM Tris/HCl,0.1% SDS),在46°C或37℃的水浴中浸泡30分鐘。
(5) 再利用純水浸泡10分鐘,去除多余的鹽分。每片加50μL 抗熒光淬滅劑DAPI,室溫避光靜置20分鐘。觀察結(jié)果。
(6) 在40倍或60倍或100倍熒光顯微鏡下觀察,拍照。
3.血清和嘔吐物的細菌原位雜交:
(7) 細菌FISH探針的濃度為25-60μg/ml,即大約5-25μM濃度,雜交液稀釋20-50倍。
(8) 將血清或嘔吐物,混合10秒,12000rpm,離心1分鐘,用鉆石筆在玻璃上畫圈,利用移液槍滴加20-50μL的細菌,將載玻片置于56℃30min,或室溫干燥1-24小時。
(9) 滴加梯度乙醇濃度(50%,85%和95%)脫水,每次1分鐘。將載玻片風干,約20分鐘。
(10) 雜交液稀釋細菌探針(1:50)。取50μL探針滴液加到玻片,蓋玻片覆蓋,多出溶液用紙巾擦拭。放入孵育盒,然后蓋好密封蓋,避光56°C中雜交2小時或37℃過夜。
(11) 配置洗滌緩沖液(700mM NaCl 72 mL, 17mM Tris/HCl,0.1% SDS),在46°C或37℃的水浴中浸泡10-30分鐘。
(12) 再利用純水浸泡10分鐘,用手甩干。每片加50μL 抗熒光淬滅劑DAPI,室溫避光靜置20分鐘。熒光顯微鏡下,觀察結(jié)果,拍照。
4.流式細胞與核酸雜交技術(shù)結(jié)合----細菌檢測
外顯子生物專業(yè)提供熒光原位雜交探針多年,探針涵蓋DNA、mRNA、miRNA、cicrRNA、LncRNA、nascent RNA、piRNA、細菌、真菌、寄生蟲等原位雜交探針以及配套試劑盒和配套原位雜交檢測設(shè)備。熟練應用各種核酸探針標記方法。
流式細胞術(shù)應用廣泛,我們利用流式細胞術(shù)與FISH技術(shù)結(jié)合,對培養(yǎng)的細菌、血液微生物,血液培養(yǎng)、痰液、肺泡灌洗液、污染的食品痰進行探針雜交,然后進行流式分析,發(fā)現(xiàn)探針雜交后細菌能很好地應用于流式分析和分選出目的細菌,可以在感染血液、痰液等樣品中快速檢測和識別感染的種水平的微生物。與常規(guī)實驗室方法PCR、測序、培養(yǎng)等技術(shù)。流式-FISH結(jié)合的方法,快速檢測特定的細菌,初步試驗還表明可以對細菌進行分選,檢測常見感染10多種微生物,如肺炎克雷伯氏菌屬肺炎克雷伯菌,鏈球菌、金黃色葡萄球菌,致病大腸桿菌等等,甚至還有一些真菌和部分寄生蟲。
流式細胞技術(shù)應用于原位雜交,對標本處理要求不同,不需要用福爾馬林固定,對標本是當處理,適合用于快速鑒別在各種肺部感染、敗血癥患者、腸道感染微生物檢測,能達到屬或種的水平檢測。
流式細胞檢測細菌實驗步驟
(1) 血清、污水、嘔吐物、牛奶等液體,適當?shù)娜芤禾幚恚?/span>8000rpm,離心1分鐘;
(2) 吸取上清20μL,加入配置好的核酸探針,85℃加熱樣品5分鐘,60℃孵育30分鐘;
(3) 流式細胞儀上機檢測,流式務必做好對照。包括只含空白探針對照、單純待檢測樣品對照、待檢測樣品對照。
(4) 結(jié)果分析,設(shè)門的時候需要,顆粒大小參考對照,熒光變化參考對照。
如果遇到更多問題,請聯(lián)系我們。我們提供探針、試劑盒、耗材、設(shè)備等等。
聯(lián)系電話:020-89895006 180 1199 7127 (24小時) E mail:focobio@126.com
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